Nel corpo ci sono due arterie temporali profonde. Queste arterie sono chiamate arterie temporali profonde posteriori e anteriori. L'arteria temporale profonda anteriore e il suo partner si trovano tra il pericranio (una membrana che copre la superficie esterna del cranio) e i muscoli temporali, che si estendono su ciascun lato della testa.
Le due arterie temporali profonde si collegano con l'arteria temporale media e insieme forniscono sangue ai muscoli. L'arteria temporale profonda anteriore ha piccoli rami che attraversano l'osso zigomatico (guancia), comunicando con l'arteria lacrimale. Questa arteria attraversa anche la grande ala dello sfenoide, un osso alla base del cranio.
L'arteria temporale profonda anteriore è un ramo dell'arteria mascellare. Può essere separato dalle altre arterie, come l'arteria temporale profonda posteriore, o combinato, formando un tronco dall'arteria mascellare. L'arteria temporale media sarà sempre separata; tuttavia l'arteria temporale profonda anteriore e il suo partner posteriore possono combinarsi con l'afflusso di sangue di altre arterie nella testa.